Hitri gumb Sync (Sinhroniziraj) služi sinhronizaciji naše knjižnice referenc v vseh različicah Mendeleya, ki jih uporabljamo (spletno, namizno, mobilno) in tako posodobi našo bazo, datoteke PDF in morebitne beležke.
Za nemoteno uporabo vtičnika Cite-O-Matic pred začetkom vstavljanja citatov v MS Wordu knjižnico referenc sinhroniziramo, v kolikor smo v knjižnico dodajali nove reference.