Mendeley omogoča zelo enostavno organizacijo naše knjižnice referenc. Reference si lahko ogledujemo po različnih kriterijih:
- vsi dokumenti (All documents): prikaz vseh referenc in dokumentov v naši knjižnici;
- nedavno dodani dokumenti (Recently Added): prikaz dokumentov, ki smo jih v knjižnico dodali v zadnjih 14 dneh;
- priljubljeni dokumenti (Favourites): prikaz dokumentov, ki smo jih označili kot priljubljene ( );
- dokumenti potrebni revizije (Needs Review): prikaz dokumentov, za katere Mendeley smatra, da vsebujejo napake in jih izpostavi za naše morebitne popravke;
- moje publikacije (My Publications): prikaz naših avtorskih dokumentov, v kolikor smo jih dodali v knjižnico;
- neuvrščeni dokumenti (Unsorted): prikaz dokumentov, ki jih nismo uvrstili v nobeno mapo;
- dokumenti, uvrščeni v mape(Folders): prikaz dokumentov po mapah, ki smo jih ustvarili sami.
Prikaz referenc lahko prilagajamo tudi z uporabo filtrov v levi spodnji polovici zaslona. Filtriranje seznama je možno glede na:
imena avtorjev,
ključne besede,
oznake (Tags), ki jih dokumentom dodajamo sami,
imena publikacij.
Prikaz organizacije in uporabe knjižnice referenc si lahko ogledate v spodnji video predstavitvi: