Orodje Mendeley vsebuje tudi aplikacijo za pregledovanje dokumentov PDF, ki jih lahko dodamo v knjižnico referenc. Do celotnega besedila tako dostopamo s klikom na ikono ob zapisu reference.
Poleg branja dokumentov, pregledovalnik omogoča tudi osnovno označevanje besedila v poljubnih barvah ter dodajanje beležk na poljubna mesta v besedilu. S klikom na Sync zagotovimo, da se spremembe sinhronizirajo.
Če želimo dokument PDF, ki smo ga opremili z oznakami in/ali opombami izvoziti, to storimo s klikom na File -> Export PDF with Annotations.
Za izvoz dokumenta PDF vključno z oznakami in opombami, pustimo obkljukano možnost Notes.
Izberemo mesto v računalniku, kamor želimo shraniti opremljeni dokument in ga shranimo (Save).