Orodje EndNote omogoča več načinov dodajanja referenc v knjižnico. Izbirate lahko med naslednjimi možnostmi:
- ročno dodajanje referenc,
- uvoz referenc s pomočjo uvoznih filtrov (File > Import),
- neposreden izvoz iz knjižničnih katalogov in ostalih spletnih baz podatkov (npr. Web of Science, PubMed, ProQuest).
